RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF639	Q9UID6	485 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667		A0A1W2PQM1	296 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SGK494	L7N484	410 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PLOD3	O60568	738 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BMP10	O95393	424 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MED26	O95402	600 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ONECUT2	O95948	504 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SERPINA1	P01009	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	IFNA14	P01570	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SEMG1	P04279	462 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NUDT7	P0C024	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CD82	P27701	267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CCKBR	P32239	447 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GPC1	P35052	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SOAT1	P35610	550 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ARL4D	P49703	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	HSD17B7	P56937	341 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SESN3	P58005	492 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ACY1	Q03154	408 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MAP4K2	Q12851	820 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GNA13	Q14344	377 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	TRIP10	Q15642	601 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	AMZ1	Q400G9	498 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	OR2L13	Q8N349	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NKD1	Q969G9	470 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NCLN	Q969V3	563 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CSF3R	Q99062	836 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		K7EM74	188 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	AGRP	O00253	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HMGN4	O00479	90 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CLDN4	O14493	209 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CLOCK	O15516	846 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RDH16	O75452	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TIPRL	O75663	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR2B3	O76000	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	AGR2	O95994	175 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LDLR	P01130	860 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GUSB	P08236	651 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LIF	P15018	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ACADS	P16219	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SOX18	P35713	384 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CLCN2	P51788	898 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CRYBA2	P53672	197 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ITGA1	P56199	1179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SELENOW	P63302	87 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CCL7	P80098	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FOLH1	Q04609	750 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MGAT2	Q10469	447 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SCARB2	Q14108	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NKG7	Q16617	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LGI4	Q8N135	537 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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