RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 ADH6P28332 368 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 GTDC1Q4AE62 458 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 PTERQ96BW5 349 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 PGAM5Q96HS1 289 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FAM189BP81408 668 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FGL2Q14314 439 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 RAB30Q15771 203 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.29■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQU0 124 aa20.29■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 KDM1BQ8NB78 822 aa20.29■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 CD70P32970 193 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 FOXA1P55317 472 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 GSTM4Q03013 218 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 BATFQ16520 125 aa20.27■□□□□ 0.84
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