RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	UGT2B10	P36537	528 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	GP5	P40197	560 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	DR1	Q01658	176 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	MGAT2	Q10469	447 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	NNAT	Q16517	81 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CDKL2	Q92772	493 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ITPA	Q9BY32	194 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	FAM159B	A6NKW6	160 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	T	O15178	435 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ZIC3	O60481	467 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	DRD5	P21918	477 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	NEK2	P51955	445 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	HMGCS1	Q01581	520 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	VWA1	Q6PCB0	445 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CYS1	Q717R9	158 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PGM2	Q96G03	612 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SFXN2	Q96NB2	322 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SERPINI1	Q99574	410 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	C16orf97	H3BN30	126 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CBX7	O95931	251 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CGA	P01215	116 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ATP1B1	P05026	303 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	POU2F1	P14859	743 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PPIC	P45877	212 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	EHD3	Q9NZN3	535 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TCF4-238	ENST00000568169	SYCE1L	A8MT33	242 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169		B4DXG7	233 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	EMC8	O43402	210 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TMCC2	O75069	709 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SOX30	O94993	753 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KLK1	P06870	262 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CRABP2	P29373	138 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PIK3CG	P48736	1102 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	EMD	P50402	254 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CLDN15	P56746	228 aa		10.27	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms