RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OPRM1P35372 400 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SOX3P41225 446 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HNF4AP41235 474 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GDF5P43026 501 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 DNASE1L1P49184 302 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RASSF2P50749 326 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KCNJ2P63252 427 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RGS1Q08116 209 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 METTL6Q8TCB7 284 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 AGR3Q8TD06 166 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SGCZQ96LD1 299 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR4K3Q96R72 315 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR52B2Q96RD2 323 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RASL10BQ96S79 203 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MYOTQ9UBF9 498 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPR1 153 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 URADA6NGE7 173 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 H0YIV9 168 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PIP5K1BO14986 540 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CRCPO75575 148 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KRT6AP02538 564 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KRT6BP04259 564 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 T-ENOLP0DO92 83 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HSD3B1P14060 373 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CTSSP25774 331 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HSD3B2P26439 372 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KRT6CP48668 564 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MNAT1P51948 309 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF136P52737 540 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 WNT3P56703 355 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TBPL1P62380 186 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NAE1Q13564 534 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ACKR1Q16570 336 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GSTA3Q16772 222 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OPN5Q6U736 354 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LCTLQ6UWM7 567 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HSDL2Q6YN16 418 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 C17orf64Q86WR6 236 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HAUS8Q9BT25 410 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf21Q9H246 121 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ACTR8Q9H981 624 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ASIC5Q9NY37 505 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SNX6Q9UNH7 406 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.53□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 E9PBE3 544 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SLC28A1O00337 649 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 UBDO15205 165 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 OR1F1O43749 312 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PRAMEF4O60810 478 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ULK1O75385 1050 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA16P05015 189 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 NID1P14543 1247 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 NPPBP16860 134 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 LBPP18428 481 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 HMOX2P30519 316 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SCTRP47872 440 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 TRPC1P48995 793 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PTH2RP49190 550 aa8.52□□□□□ -1.05
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