RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CIB2O75838 187 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PDE9AO76083 593 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 NKX2-2O95096 273 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CBX7O95931 251 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 SERPINA7P05543 415 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 LIFP15018 202 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 NAGAP17050 411 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 HTR1EP28566 365 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 EMDP50402 254 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 SLC7A2P52569 658 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 NCALDP61601 193 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 RNF4P78317 190 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 HPCAP84074 193 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 LIPEQ05469 1076 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 DUSP2Q05923 314 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CLN3Q13286 438 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 GAB1Q13480 694 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PCOLCEQ15113 449 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 LTB4RQ15722 352 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 BTBD16Q32M84 506 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 MTX3Q5HYI7 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 MRGPREQ86SM8 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 PROSER1Q86XN7 944 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 RNF130Q86XS8 419 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 SLC5A8Q8N695 610 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 GIMAP5Q96F15 307 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 MAGED4Q96JG8 741 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 BTBD9Q96Q07 612 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 THTPAQ9BU02 230 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 BTBD2Q9BX70 525 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TRIM15Q9C019 465 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TRIM4Q9C037 500 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 NME4O00746 187 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TO15178 435 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 GSTA4O15217 222 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 TNFRSF21O75509 655 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CT62P0C5K7 136 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 CD1EP15812 388 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 SSTR4P31391 388 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 KRT20P35900 424 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-220ENST00000550700 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 REEP3Q6NUK4 255 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-220ENST00000550700 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.65□□□□□ -1.02
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