RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CMIPQ8IY22 773 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TEX26Q8N6G2 289 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SPERTQ8NA61 448 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR8K5Q8NH50 307 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SLC39A13Q96H72 371 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF43P17038 809 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 AGRPO00253 132 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SCAMP1O15126 338 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 VILLO15195 856 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CD38P28907 300 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 EMP2P54851 167 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CXCR4P61073 352 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TGFBR3Q03167 851 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 NSDHLQ15738 373 aa8.06□□□□□ -1.12
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