RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 EOGTQ5NDL2 527 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 Q6ZSR6 202 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 TUBA1AQ71U36 451 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 IQCHQ86VS3 1027 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR8J1Q8NGP2 316 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SLC35A4Q96G79 324 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ROGDIQ9GZN7 287 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CALML5Q9NZT1 146 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 PHF11Q9UIL8 331 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 DAPP1Q9UN19 280 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 IFT52Q9Y366 437 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR6C74A6NCV1 312 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ALPPP05187 535 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 BMP4P12644 408 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CPN2P22792 545 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 INAVAQ3KP66 663 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 DEFB134Q4QY38 66 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 MFSD12Q6NUT3 480 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CASP12Q6UXS9 341 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 VRK2Q86Y07 508 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 PATE1Q8WXA2 126 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 FGF11Q92914 225 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 Q96MT0 163 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 EVA1BQ9NVM1 165 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CD207Q9UJ71 328 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 A0A087WUU8 490 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 GSAPA4D1B5 854 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 TNNI3P19429 210 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 LSSP48449 732 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 PDX1P52945 283 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ITGADQ13349 1161 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CCINQ13939 588 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OCLNQ16625 522 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 MFSD4BQ5TF39 518 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CENPSQ8N2Z9 138 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR2L13Q8N349 312 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 IQCF1Q8N6M8 205 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SLC16A11Q8NCK7 471 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR13H1Q8NG92 308 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR10G6Q8NH81 332 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ZFPM2Q8WW38 1151 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 DIO2Q92813 273 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 MS4A4EQ96PG1 132 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 PRR14Q9BWN1 585 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR51E2Q9H255 320 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ANKHQ9HCJ1 492 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 PRDM9Q9NQV7 894 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SLC22A7Q9Y694 548 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 FRS3O43559 492 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 FCMRO60667 390 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SEMA4FO95754 770 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 IGHV4-34P06331 123 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 PRKAR1BP31321 381 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 EFNB1P98172 346 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CDK5Q00535 292 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 RELAQ04206 551 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 FAM214AQ32MH5 1076 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SLC25A30Q5SVS4 291 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CDC73Q6P1J9 531 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 USP43Q70EL4 1123 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 C16orf62Q7Z3J2 963 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 ATCAYQ86WG3 371 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 TCEANCQ8N8B7 351 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 CAMKVQ8NCB2 501 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMK1-208ENST00000538333 OR4K14Q8NGD5 310 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms