RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC25Q86WR0 208 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC15Q8N387 334 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP112Q8N8E3 955 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC89Q8N998 374 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCUQ8NE86 351 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD17B8Q92506 261 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OMA1Q96E52 524 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EGFL8Q99944 293 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF747Q9BV97 191 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10A5Q9H207 317 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNKQ9P0W0 207 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WHRNQ9P202 907 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF175Q9Y473 711 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.07□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VWC2LB2RUY7 222 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E7EQL1 145 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM77I1YAP6 450 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01387J3KSC0 135 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSF3P09919 207 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT62P0C5K7 136 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL6A2P12110 1019 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSR2P43308 183 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDLIM4P50479 330 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FABP6P51161 128 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFNA4P52798 201 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKN2DP55273 166 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGCS1Q01581 520 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNTA1Q13424 505 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK11Q15831 433 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADCY4Q8NFM4 1077 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TANKQ92844 425 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS39Q96JC1 886 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10A4Q9H209 315 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAK5Q9P286 719 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XPR1Q9UBH6 696 aa9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B4DXG7 233 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIASO43766 372 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR75O95800 540 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AIFM1O95831 613 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGFB1P01137 390 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCGR2AP12318 317 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HK1P19367 917 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL2RGP31785 369 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL2P60568 153 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BIKQ13323 160 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR180Q86V85 440 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.05□□□□□ -0.96
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP3B1O00203 1094 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms