RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD226Q15762 336 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDKN3Q16667 212 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPP1R27Q86WC6 154 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 GVQW1Q8N7I0 195 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC4A11Q8NBS3 891 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RFESDQ8TAC1 157 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD99L2Q8TCZ2 262 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RFFLQ8WZ73 363 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP6NLQ92738 828 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 FGGYQ96C11 551 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 FUT8Q9BYC5 575 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 LHX9Q9NQ69 397 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SOHLH2Q9NX45 425 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 DUX4Q9UBX2 424 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPTA1P02549 2419 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 TACC2O95359 2948 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSPG2P98160 4391 aa0.06□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 FRYQ5TBA9 3013 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 GJE1A6NN92 205 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 C11orf94C9JXX5 98 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTGES3LE9PB15 166 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTGESO14684 152 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIAA0513O60268 411 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 NPIPB7O75200 414 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CSO75390 466 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CISD3P0C7P0 127 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 LAMP2P13473 410 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SAT1P21673 171 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACKR3P25106 362 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 HOXA9P31269 272 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPL27P61353 136 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPL32P62910 135 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 IL18R1Q13478 541 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CEACAM7Q14002 265 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTPRCAPQ14761 206 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR2B11Q5JQS5 317 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAB41Q5JT25 222 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 METTL11BQ5VVY1 283 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLPP4Q5VZY2 271 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 MOB2Q70IA6 237 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 TLK2Q86UE8 772 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SYT14Q8NB59 555 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR2AP1Q8NGE2 309 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SYNPRQ8TBG9 265 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 FBXO25Q8TCJ0 367 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM173AQ9BQD7 235 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 APOL6Q9BWW8 343 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 DCLRE1BQ9H816 532 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 NGBQ9NPG2 151 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PIGVQ9NUD9 493 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDRG1Q9NUG6 133 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 IFT52Q9Y366 437 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 RNF115Q9Y4L5 304 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEC16AO15027 2179 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 MUC4Q99102 2169 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CENPEQ02224 2701 aa0.05□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 VPS13AQ96RL7 3174 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 APC2O95996 2303 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANK2Q01484 3957 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 XIRP2A4UGR9 3374 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 FREM1Q5H8C1 2179 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 A8MUA0 341 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 K7N7A8 449 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCSO14618 274 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 TBX10O75333 385 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANXA9O76027 345 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCGB1D1O95968 90 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 PCCBP05166 539 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 NF2P35240 595 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ALDH3B2P48448 385 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 MTCP1P56278 107 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACSM1Q08AH1 577 aa0.04□□□□□ -2.4
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC39A6Q13433 755 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms