RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGPAT1Q99943 283 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C17orf62Q9BQA9 187 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LZTS2Q9BRK4 669 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OSBPL11Q9BXB4 747 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPK1Q9H3S4 243 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APMAPQ9HDC9 416 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIDEBQ9UHD4 219 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FZR1Q9UM11 496 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATG4BQ9Y4P1 393 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RLFQ13129 1914 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EM74 188 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7ENP7 123 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0R296 226 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PES1O00541 588 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AHCYL1O43865 530 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRAP2O75791 330 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGLSO95336 258 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLU7O95391 586 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf47O95873 294 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRB1P04280 392 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 P0C880 135 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMA3P25788 255 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFPI2P48307 235 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP5CP53041 499 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOLH1Q04609 750 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL18R1Q13478 541 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC57Q2TAC2 916 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9orf152Q5JTZ5 239 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPIN3Q5JUX0 258 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LY6G6FQ5SQ64 297 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNLZQ5SXM8 178 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACP7Q6ZNF0 438 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAATS1Q7Z4T9 603 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR142Q7Z601 462 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R27Q86WC6 154 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52P1PQ8NH57 321 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA5Q8TBA6 731 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA18Q8TC71 538 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP170P1Q96L14 293 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSNARE1Q96NA8 513 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM14Q96QK8 99 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TXN2Q99757 166 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C19orf43Q9BQ61 176 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDF4Q9BRK5 362 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUT8Q9BYC5 575 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRN1Q9NPD7 142 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GDF3Q9NR23 364 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIRT7Q9NRC8 400 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C5AR2Q9P296 337 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPC4Q9UBN4 977 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS6KA6Q9UK32 745 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR34Q9UPC5 381 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVW-1Q9UQF0 538 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM5Q9Y2B1 443 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX8Q9Y5X2 465 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa0.11□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THSD7BQ9C0I4 1608 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C5orf52A6NGY3 159 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHUKO15111 745 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SELENOFO60613 162 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEDDO75618 318 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BBOX1O75936 387 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDE5AO76074 875 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXB7P09629 217 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHOXF2BP0C7M4 288 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR2F1P10589 423 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALOX12P18054 663 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT1A5P35504 534 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NNMTP40261 264 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STARP49675 285 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOC4P55056 127 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTTPP55157 894 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMM10P62072 90 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTA2P62736 377 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTC1P68032 377 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PUDPQ08623 228 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPYSQ14117 519 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF273Q14593 569 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF9Q16594 264 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAGE3Q5JUK9 113 aa0.1□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LGSNQ5TDP6 509 aa0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms