RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB5P36952 375 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP6P55212 293 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A2Q5DJT8 189 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 EMC4Q5J8M3 183 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF781Q8N8C0 355 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4N2Q8NGD1 307 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT8Q8WV74 236 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TMBIM1Q969X1 311 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PGM2Q96G03 612 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF597Q96LX8 424 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A15Q9H2J7 730 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT9Q9HCQ5 603 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CNIH4Q9P003 139 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRR3Q9UBC9 169 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PRODH2Q9UF12 536 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CFL2Q9Y281 166 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 MAST4O15021 2626 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PLOD3O60568 738 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX11AO75192 247 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ERN1O75460 977 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMG1O95456 288 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHG3P01860 377 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 BCKDHAP12694 445 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGDSP41222 190 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPB3Q12988 150 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE7AQ13946 482 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGR1Q14914 329 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 LRIG3Q6UXM1 1119 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TRILQ7L0X0 811 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC34A3Q8N130 599 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 DMRTA2Q96SC8 542 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SORT1Q99523 831 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP64Q9NPA5 681 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPLA3Q9NST1 481 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPEQ02224 2701 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf51A8MQB3 221 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPA2E9PIF3 369 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPA3F8WFD2 350 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 UPK1AO00322 258 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PRRG2O14669 202 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TP53I11O14683 189 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TM9SF1O15321 606 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PDPK1O15530 556 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA4LO95757 839 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINE1P05121 402 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBBP07437 444 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 GRNP28799 593 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 MPIP34949 423 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP3P42574 277 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PPICP45877 212 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS9BPQ6ZS82 235 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 MRGPRGQ86SM5 289 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 LIX1Q8N485 282 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 NTNG2Q96CW9 530 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ERP27Q96DN0 273 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPBAP1Q96EW2 488 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGPTL4Q9BY76 406 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 REEP4Q9H6H4 257 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK9Q9NPC2 374 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1DQ01668 2161 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 NAV2Q8IVL1 2488 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf72A6NCS6 295 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN14A8MX76 684 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TO15178 435 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOX3O15254 700 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ZWINTO95229 277 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 DRD5P21918 477 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 GDF1P27539 372 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 DCTP40126 519 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK9P50750 372 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PSG6Q00889 435 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2L13Q8N349 312 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5M9Q8NGP3 310 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PPCDCQ96CD2 204 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 OSBPL11Q9BXB4 747 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL7AQ9H8H3 244 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TMED5Q9Y3A6 229 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 DOCK7Q96N67 2140 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WV62 115 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GVC2 190 aa17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms