RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A1P30531 599 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GGTA1PQ4G0N0 100 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GDPD4Q6W3E5 623 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPAT4Q86UL3 456 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC30A8Q8IWU4 369 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MS4A15Q8N5U1 240 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MARC2Q969Z3 335 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NXPE2Q96DL1 559 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SGTBQ96EQ0 304 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OR4K3Q96R72 315 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PHF11Q9UIL8 331 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPR52Q9Y2T5 361 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 AUP1Q9Y679 476 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RFXAPO00287 272 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN6O43657 245 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PROS1P07225 676 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ELK1P19419 428 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SOX18P35713 384 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 DOC2AQ14183 400 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SEC23BQ15437 767 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TRIM40Q6P9F5 258 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TRILQ7L0X0 811 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ADIPOR2Q86V24 386 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ADGRG3Q86Y34 549 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RFT1Q96AA3 541 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C12orf66Q96MD2 445 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HHIPQ96QV1 700 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CHIAQ9BZP6 476 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SEMA3GQ9NS98 782 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ATPIF1Q9UII2 106 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CTSLP07711 333 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ACSM4P0C7M7 580 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 JUPP14923 745 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CSF2RAP15509 400 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PDHA2P29803 388 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 WDR5P61964 334 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HTRA3P83110 453 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ILKQ13418 452 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NAE1Q13564 534 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RIN1Q13671 783 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ARSIQ5FYB1 569 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TMEM107Q6UX40 140 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FTMTQ8N4E7 242 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OR8K5Q8NH50 307 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 EMC7Q9NPA0 242 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FZD3Q9NPG1 666 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 REV3LO60673 3130 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C5orf58C9J3I9 102 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SGK494L7N484 410 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GRM6O15303 877 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FGF18O76093 207 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ADAP00813 363 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CTSAP10619 480 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 METAP1P53582 386 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 BTG1P62324 171 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PUDPQ08623 228 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GINS1Q14691 196 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC5A12Q1EHB4 618 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OR6M1Q8NGM8 313 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MED18Q9BUE0 208 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 BAIAP2Q9UQB8 552 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 POM121CA8CG34 1229 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 A8MVJ9 347 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FFAR1O14842 300 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TYRP14679 529 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1E1P36543 226 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HNMTP50135 292 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HMGA2P52926 109 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LIM2P55344 173 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TEAD2Q15562 447 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SYT14P1Q58G82 188 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 QSOX2Q6ZRP7 698 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 WDR20Q8TBZ3 569 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C19orf43Q9BQ61 176 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 REV1Q9UBZ9 1251 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 BTNL2Q9UIR0 455 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LGALS8O00214 317 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SAP18O00422 153 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LAG3P18627 525 aa12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms