RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 ACTR1BP42025 376 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PTGIRP43119 386 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDH3B1P43353 468 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 VSNL1P62760 191 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CTBSQ01459 385 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ACVR1Q04771 509 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GPS1Q13098 491 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NFATC2Q13469 925 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PEX6Q13608 980 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SELPLGQ14242 412 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SSX9Q7RTT3 188 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM135Q86UB9 458 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM129CQ86XR2 697 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 STYXQ8WUJ0 223 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PATE1Q8WXA2 126 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 UFD1Q92890 307 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 REPS1Q96D71 796 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 C14orf79Q96F83 325 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DDA1Q9BW61 102 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2AG1Q9H205 316 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 COA4Q9NYJ1 87 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CTSFQ9UBX1 484 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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RPUSD3-212ENST00000466141 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A075B6Q4 140 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC160A6NGH7 325 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SYT5O00445 386 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SEC14L5O43304 696 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GRID2O43424 1007 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 VEGFDO43915 354 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 UGT1A9O60656 530 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CLPXO76031 633 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MFN2O95140 757 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MLYCDO95822 493 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 EML2O95834 649 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 IFNA4P05014 189 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 THRAP10827 490 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 COX4I1P13073 169 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ACP5P13686 325 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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RPUSD3-212ENST00000466141 UGT1A6P19224 532 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TCN2P20062 427 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 HNF1AP20823 631 aa6.88□□□□□ -1.31
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RPUSD3-212ENST00000466141 UGT1A1P22309 533 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 UGT1A4P22310 534 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 IVDP26440 423 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CD1BP29016 333 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 FOXN2P32314 431 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CRHR1P34998 444 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GRK3P35626 688 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CDKN2CP42773 168 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MAGEA3P43357 314 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP5CP53041 499 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CTSCP53634 463 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 LIMK2P53671 638 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MC1RQ01726 317 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.88□□□□□ -1.31
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