RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 TEX9Q8N6V9 391 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ZNF610Q8N9Z0 462 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FBXO36Q8NEA4 188 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 STAG3L4Q8TBR4 150 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 HGDQ93099 445 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 REPS1Q96D71 796 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 TMCO6Q96DC7 493 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ITPAQ9BY32 194 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ALG9Q9H6U8 611 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FBXL2Q9UKC9 423 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PROCRQ9UNN8 238 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 DTX4Q9Y2E6 619 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 JRKLQ9Y4A0 524 aa12.88□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 A0A087X1B8 175 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CPMP14384 443 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PORP16435 677 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 DPP4P27487 766 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PTGDSP41222 190 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 29.3
CENPF-202ENST00000464322 PPP4R4Q6NUP7 873 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 TMEM81Q6P7N7 255 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FAM111BQ6SJ93 734 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 OR4K17Q8NGC6 315 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FIG4Q92562 907 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 REG4Q9BYZ8 158 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 MOCS1Q9NZB8 636 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 NUDT4Q9NZJ9 180 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 HEY2Q9UBP5 337 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 LAMP3Q9UQV4 416 aa12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 UBXN8O00124 270 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ACOX3O15254 700 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 SEC14L5O43304 696 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 EMC8O43402 210 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 HCRTR2O43614 444 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PLAUP00749 431 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PEPDP12955 493 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CDC25BP30305 580 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CCKARP32238 428 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ARFIP1P53367 373 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 HMGCS1Q01581 520 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 OCRLQ01968 901 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 KRTAP1-1Q07627 177 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 E2F2Q14209 437 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 C22orf34Q6ZV56 151 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 SH2D5Q6ZV89 423 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 RAPH1Q70E73 1250 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 WFDC8Q8IUA0 241 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CDKL2Q92772 493 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PINK1Q9BXM7 581 aa12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 C3orf80F5H4A9 247 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 HS3ST1O14792 307 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 KLK1P06870 262 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PAX1P15863 534 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 IDUAP35475 653 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 KRT20P35900 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 GMPRP36959 345 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CUL3Q13618 768 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 FGFBP1Q14512 234 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 SLMAPQ14BN4 828 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 BCL2A1Q16548 175 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 LIPJQ5W064 366 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 HIPK1Q86Z02 1210 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 CAVIN3Q969G5 261 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 TMBIM1Q969X1 311 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PLPPR2Q96GM1 343 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 MARK4Q96L34 752 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 COL21A1Q96P44 957 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ADOQ96SZ5 270 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 NMRAL1Q9HBL8 299 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PRODH2Q9UF12 536 aa12.85□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 LRRC14BA6NHZ5 514 aa12.84□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 ZIC3O60481 467 aa12.84□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 TMCC2O75069 709 aa12.84□□□□□ -0.35
CENPF-202ENST00000464322 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms