RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB3DO95716 219 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM107AO95990 144 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CSF2P04141 144 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PROS1P07225 676 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FGF4P08620 206 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 IQCF3P0C7M6 154 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 STAG3L3P0CL85 134 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SMIM18P0DKX4 95 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC2A3P11169 496 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GNSP15586 552 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CBLP22681 906 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FCARP24071 287 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SSTR1P30872 391 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ADRA1AP35348 466 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SPAM1P38567 509 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MPLP40238 635 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFRSF4P43489 277 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC6A8P48029 635 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NPY2RP49146 381 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SPCS3P61009 180 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP6V0D1P61421 351 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NAA20P61599 178 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GUCY2DQ02846 1103 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAF2Q12933 501 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 STX5Q13190 355 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PMS2P3Q13401 168 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CHRNA6Q15825 494 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LIN52Q52LA3 116 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LIN9Q5TKA1 542 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SUSD4Q5VX71 490 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM69Q86WT6 500 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TRPV3Q8NET8 790 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RDM1Q8NG50 284 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 OR5T1Q8NG75 326 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM122AQ96E09 287 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM19Q96HH6 336 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR137Q96N19 417 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 BTBD9Q96Q07 612 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SYT15Q9BQS2 421 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 EDEM2Q9BV94 578 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC22A4Q9H015 551 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 EXO5Q9H790 373 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NOX4Q9NPH5 578 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 THSD1Q9NS62 852 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 EXD2Q9NVH0 621 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CMTM6Q9NX76 183 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 BARHL2Q9NY43 387 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 C1RLQ9NZP8 487 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC42Q9Y546 428 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms