RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CBX7O95931 251 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CLPSP04118 112 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PTGER1P34995 402 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MLF1P58340 268 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPB3Q12988 150 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NUDT8Q8WV74 236 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ELP4Q96EB1 424 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX37Q96LM6 180 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 IL6P05231 212 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GPX3P22352 226 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 IL12AP29459 219 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SOX18P35713 384 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 VHLP40337 213 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SQLEQ14534 574 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FHL5Q5TD97 284 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM107Q6UX40 140 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ATCAYQ86WG3 371 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR7G2Q8NG99 324 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NPAS2Q99743 824 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF32Q9H0A6 362 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf14Q9HBI5 128 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MRGBPQ9NV56 204 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MYOTQ9UBF9 498 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DYTNA2CJ06 578 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM234BA2RU67 622 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DPM1O60762 260 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MC3RP41968 323 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 WNT3P56703 355 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PAOXQ6QHF9 649 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2L13Q8N349 312 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 HAS2Q92819 552 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TP53INP1Q96A56 240 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNT8Q9NY28 637 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NTMQ9P121 344 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 UPK1AO00322 258 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CFLARO15519 480 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf47O95873 294 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PDGFAP04085 211 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PGRP06401 933 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 EMDP50402 254 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAF7P61962 342 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PIGGQ5H8A4 983 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC80Q76M96 950 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 BEST3Q8N1M1 668 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC15A4Q8N697 577 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52E6Q96RD3 313 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 WWP2O00308 870 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 EMC8O43402 210 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MAN1A2O60476 641 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SCN2BO60939 215 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGA10O75578 1167 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2J2O76002 312 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 WDPCPO95876 746 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GP1BBP13224 206 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms