RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 FGF22Q9HCT0 170 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 HYKKA2RU49 373 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MYL12BO14950 172 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ASNA1O43681 348 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 KDM1AO60341 852 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 RAB36O95755 333 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 TNFSF8P32971 234 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ETV5P41161 510 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ETV1P50549 477 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SMSP52788 366 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 VRK2Q86Y07 508 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3R3Q92569 461 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SIAEQ9HAT2 523 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MYO10Q9HD67 2058 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.03■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 K7EQS6 105 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 FRS3O43559 492 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 CYP7B1O75881 506 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 DLGAP3O95886 979 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ASGR2P07307 311 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MAGP20916 626 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SEC13P55735 322 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SNAPC1Q16533 368 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 GANCQ8TET4 914 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 DIO2Q92813 273 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 EQTNQ9NQ60 294 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 GDI1P31150 447 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SELENBP1Q13228 472 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 C10orf90Q96M02 699 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL3Q9UH77 587 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 SNX7Q9UNH6 387 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 TRAPPC4Q9Y296 219 aa15.02■□□□□ -0
SHQ1-202ENST00000444040 ISM1B1AKI9 464 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 EML2O95834 649 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TAS2R41P59536 307 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TGM3Q08188 693 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 LTB4RQ15722 352 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 DESI1Q6ICB0 168 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 USP30Q70CQ3 517 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PAQR7Q86WK9 346 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KCT2Q8NC54 265 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM163Q8TC26 289 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TXNDC15Q96J42 360 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC32Q9BV29 185 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KLF15Q9UIH9 416 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 LIPT1Q9Y234 373 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NTN1O95631 604 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ALPPP05187 535 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ADPRHP54922 357 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BNC1Q01954 994 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TSPAN31Q12999 210 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FLCNQ8NFG4 579 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KAT2AQ92830 837 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TRANK1O15050 2925 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRODHO43272 600 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ACP2P11117 423 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CPEP16870 476 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 RORCP51449 518 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BTN3A2P78410 334 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TRAM2Q15035 370 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL22Q53GT1 634 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms