RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHKG1Q16816 387 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 VWA2Q5GFL6 755 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF10Q5QP82 559 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 LANCL3Q6ZV70 420 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAQR7Q86WK9 346 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMPDL3AQ92484 453 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ9Q92806 393 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 INPP5DQ92835 1189 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIB2Q96AX9 1013 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNF8Q96H20 258 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT12Q99456 494 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLFM1Q99784 485 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG10Q9H0Y0 220 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAG5Q9UL15 447 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSAT1Q9Y617 370 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 NINQ8N4C6 2090 aa4.15□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.15□□□□□ -1.74
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0G2JN53 185 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB14O43829 449 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPM1O60762 260 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROP1O75360 226 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEACAM4O75871 244 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALPPP05187 535 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEXBP07686 556 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA5P08758 320 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSF1P09603 554 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPC1LP0DKB6 136 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHN1P15882 459 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP11P24347 488 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IDUAP35475 653 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNF4AP41235 474 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS4P49798 205 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARSFP54793 590 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROK1P58294 105 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q0VFX4 171 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAE1Q13564 534 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLMAPQ14BN4 828 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MORF4L2Q15014 288 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCTE1Q5JU00 501 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF425Q6IV72 752 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRA10AC1Q70Z53 315 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 VN1R4Q7Z5H5 301 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC25Q86WR0 208 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf64Q86WR6 236 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCKQ8N0W5 287 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDIK1LQ8N165 341 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMER3Q8N944 861 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCUQ8NE86 351 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO36Q8NEA4 188 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR11G2Q8NGC1 345 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOCOSQ96EN8 888 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C19orf60Q96EN9 201 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.15□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms