RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429895.5

PTPRF-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 6,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-206ENST00000429895 OPN1LWP04000 364 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-206ENST00000429895 ARSAP15289 507 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-206ENST00000429895 APLNRP35414 380 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-206ENST00000429895 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-206ENST00000429895 HTRA3P83110 453 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-206ENST00000429895 CRB3Q9BUF7 120 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRF-206ENST00000429895 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-206ENST00000429895 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-206ENST00000429895 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-206ENST00000429895 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRF-206ENST00000429895 F5H5K5 113 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTPRF-206ENST00000429895 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.62□□□□□ -0.07
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