RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R16Q9NYV7 291 aa17.55■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa17.55■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLK4Q9Y5K2 254 aa17.55■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa17.55■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENTPD6O75354 484 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADRA2AP08913 450 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PVRP15151 417 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGFBR1P36897 503 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSSP48449 732 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB10P48595 397 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP12Q6UXS9 341 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD13Q7L211 337 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQCHQ86VS3 1027 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS15Q8TE58 950 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM3CQ92520 227 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35A4Q96G79 324 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRELD1Q96HD1 420 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGDIGQ99819 225 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF576Q9H609 170 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf74A8MZ97 194 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AIREO43918 545 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIPP12273 146 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLR1P78380 273 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX10Q12887 443 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL19A1Q14993 1142 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR1D2Q14995 579 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFA9Q16795 377 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM214AQ32MH5 1076 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLAG1Q6DJT9 500 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4N5Q8IXE1 308 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRMD1Q8N878 549 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC16A11Q8NCK7 471 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX4I2Q96KJ9 171 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM221BA6H8Z2 402 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF860A6NHJ4 632 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUXAA6NLW8 204 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN25C9JDP6 229 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0YGG7 62 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALOX12P18054 663 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNNI3P19429 210 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GADD45AP24522 165 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IDUAP35475 653 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDX1P52945 283 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RELAQ04206 551 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INAVAQ3KP66 663 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf94Q6P1W5 598 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF554Q86TJ5 538 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADCK1Q86TW2 530 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2L13Q8N349 312 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q96MT0 163 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKIP1Q9NQ31 210 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSGIN1Q9UJX0 560 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC13A4Q9UKG4 626 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST2Q9Y4C5 530 aa17.53■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRS3O43559 492 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCMRO60667 390 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBFA2T3O75081 653 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV3-19P01714 112 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCR5P51681 352 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R41P59536 307 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC73Q6P1J9 531 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCDC5Q6ZRR9 648 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZS52 159 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP53Q70EK8 1073 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF367Q7RTV3 350 aa17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms