RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 EPYCQ99645 322 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 NTN4Q9HB63 628 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 USE1Q9NZ43 259 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 RARRES3Q9UL19 164 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 IFT52Q9Y366 437 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SPTA1P02549 2419 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 A8MU76 341 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 A8MVJ9 347 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FAM227AF5H4B4 570 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 G3V2T6 193 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SYT5O00445 386 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LDB3O75112 727 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJB5O75953 348 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ALOX5P09917 674 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FGF5P12034 268 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF23P17027 643 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 RHCEP18577 417 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FPR1P21462 350 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 XCR1P46094 333 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 KCNJ5P48544 419 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ALDH3A2P51648 485 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CRYBA2P53672 197 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 AQP4P55087 323 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM11AP58511 58 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PSPHP78330 225 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 E2F1Q01094 437 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 KCNAB1Q14722 419 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LTB4RQ15722 352 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MAPK11Q15759 364 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SZRD1Q7Z422 152 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PROX1Q92786 737 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 KAT2AQ92830 837 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 RIT1Q92963 219 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TCEAL3Q969E4 200 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TAMM41Q96BW9 452 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TPD52L3Q96J77 140 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 VPS50Q96JG6 964 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ART5Q96L15 291 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CIB1Q99828 191 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PINK1Q9BXM7 581 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PRODH2Q9UF12 536 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CFL2Q9Y281 166 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 V9GYQ6 96 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PS29 197 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 D6RAR5 112 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 H0YAE9 185 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF2O60811 474 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 NKX2-2O95096 273 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 ALBP02768 609 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CDK4P11802 303 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 MYF5P13349 255 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CD247P20963 164 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 S1PR1P21453 382 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 ALAS2P22557 587 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CCKBRP32239 447 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 SOX18P35713 384 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 RPS6KA3P51812 740 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 HMGA2P52926 109 aa9.14□□□□□ -0.95
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