RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 TIGD5Q53EQ6 642 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 WDR20Q8TBZ3 569 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HGDQ93099 445 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RFKQ969G6 155 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TADA1Q96BN2 335 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GMLQ99445 158 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OSER1Q9NX31 292 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TTLL8A6PVC2 850 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 STK25O00506 426 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RGRP47804 291 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RAB13P51153 203 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 DSC1Q08554 894 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GSG1Q2KHT4 349 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 METTL11BQ5VVY1 283 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 FAM180BQ6P0A1 224 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 YIPF5Q969M3 257 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 KLHL31Q9H511 634 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.64□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HHLA1C9JL84 531 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 FAAHO00519 579 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RHOAP61586 193 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HBA1P69905 142 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 DGCR2P98153 550 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RAB40BQ12829 278 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 MON1AQ86VX9 555 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 LAS2Q8IYD9 372 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 THAP6Q8TBB0 222 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RAB8BQ92930 207 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ABHD1Q96SE0 405 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC19A3Q9BZV2 496 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PRODHO43272 600 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 FMO6PO60774 539 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 FAM157BP0CG42 384 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PCSK2P16519 638 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 GJA1P17302 382 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SHC1P29353 583 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 NHLRC3Q5JS37 347 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HECTD3Q5T447 861 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.63□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 EPHX1P07099 455 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 AKR1C2P52895 323 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SEMG2Q02383 582 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 AKR1C1Q04828 323 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 DUSP4Q13115 394 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 REEP3Q6NUK4 255 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 HMGN2P46Q86SG4 172 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 TEX26Q8N6G2 289 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 OR51G2Q8NGK0 314 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 NEU3Q9UQ49 428 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RCE1Q9Y256 329 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 ACP2P11117 423 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PPP3CBP16298 524 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 SLC1A3P43003 542 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 RAP2BP61225 183 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PLD1Q13393 1074 aa11.62□□□□□ -0.55
SZRD1-201ENST00000401088 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms