RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PS29 197 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 HYKKA2RU49 373 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 J3KTA2 159 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SGK494L7N484 410 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 DUX1O43812 170 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 FGF17O60258 216 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SDC3O75056 442 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 RDH16O75452 317 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 NSA2O95478 260 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CPNE6O95741 557 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 LGI1O95970 557 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 RECKO95980 971 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SLC35E2P0CK97 266 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 GNSP15586 552 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 NT5EP21589 574 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 GSTT1P30711 240 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PRKAR1BP31321 381 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PTGER1P34995 402 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CDK5R2Q13319 367 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 MEP1AQ16819 746 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZBED5Q49AG3 693 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 EIPR1Q53HC9 387 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 FGD3Q5JSP0 725 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 TCTN3Q6NUS6 607 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PRSS41Q7RTY9 318 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 NCSTNQ92542 709 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PMM1Q92871 262 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PRRC1Q96M27 445 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF285Q96NJ3 590 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 STACQ99469 402 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SUSD2Q9UGT4 822 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SATB2Q9UPW6 733 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CLDN4O14493 209 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CHST10O43529 356 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 OR10H2O60403 315 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 LDB3O75112 727 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 OR6B1O95007 311 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ALOX5P09917 674 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CBLP22681 906 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 GGT2P36268 569 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 GPR3P46089 330 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 UGT2B15P54855 530 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 RPP38P78345 283 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 GPLD1P80108 840 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 TEKQ02763 1124 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 BIKQ13323 160 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 TUBA3CQ13748 450 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 GRM7Q14831 915 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 INAVAQ3KP66 663 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 LYSMD4Q5XG99 296 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 DESI1Q6ICB0 168 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 P3H2Q8IVL5 708 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 OR4N5Q8IXE1 308 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 OR5T3Q8NGG3 340 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 OR9A4Q8NGU2 314 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SLC9A6Q92581 669 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 TGM7Q96PF1 710 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 PIGUQ9H490 435 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 STARD5Q9NSY2 213 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 LRIT1Q9P2V4 623 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PRQ8 180 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms