RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 BCKDHBP21953 392 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 CHMP24386 653 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 AHSA2Q719I0 299 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 MUL1Q969V5 352 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.22■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 MED26O95402 600 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 FOSL2P15408 326 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 DUSP5Q16690 384 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 P3H2Q8IVL5 708 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 SOX14O95416 240 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 GPR75O95800 540 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 MT-ND2P03891 347 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 ALPPP05187 535 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 PROS1P07225 676 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 NT5EP21589 574 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 CDC73Q6P1J9 531 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 IQCHQ86VS3 1027 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 DOK1Q99704 481 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.21■■□□□ 1.15
LHX3-201ENST00000371746 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 AQP9O43315 295 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ATP1B1P05026 303 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NUDT6P53370 316 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 GP2P55259 537 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 HPCAP84074 193 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CCNJQ5T5M9 372 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 KLHL35Q6PF15 583 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FAR1Q8WVX9 515 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FUZQ9BT04 418 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PINK1Q9BXM7 581 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FAAHO00519 579 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ITIH1P19827 911 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MASP1P48740 699 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 GFERP55789 205 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FHL5Q5TD97 284 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CHRDQ9H2X0 955 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.2■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MUC3AQ02505 3323 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 A0A1W2PRQ8 180 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DUXAA6NLW8 204 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CLDN24A6NM45 220 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ADAP00813 363 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ACP2P11117 423 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NXPH1P58417 271 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 HOXC5Q00444 222 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DGCR6Q14129 220 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 A0A1W2PPW3 197 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 RGS10O43665 173 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CT62P0C5K7 136 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CTSKP43235 329 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CRISP1P54107 249 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TUBA3CQ13748 450 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 GJD3Q8N144 294 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NELL2Q99435 816 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 UCK2Q9BZX2 261 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CALML5Q9NZT1 146 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CHST10O43529 356 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 AVPR1BP47901 424 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms