RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371146.5

USP1-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP1, Length 3,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-202ENST00000371146 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CPMP14384 443 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PCSK2P16519 638 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ITGA2P17301 1181 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TACR1P25103 407 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 IL12BP29460 328 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KCNK10P57789 538 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ABATP80404 500 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SNTA1Q13424 505 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CPTPQ5TA50 214 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNF605Q86T29 641 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CADM2Q8N3J6 435 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR6S1Q8NH40 331 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KCNC2Q96PR1 638 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DOHHQ9BU89 302 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 S100A14Q9HCY8 104 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NUP50Q9UKX7 468 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.6□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KALRNO60229 2985 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TXNDC9O14530 226 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 UBOX5O94941 541 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SOX30O94993 753 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SNAPINO95295 136 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MED26O95402 600 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 BPGMP07738 259 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 STT3AP46977 705 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 HERC3Q15034 1050 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FCRL6Q6DN72 434 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CDC73Q6P1J9 531 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ASB15Q8WXK1 588 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NKD1Q969G9 470 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FBXL8Q96CD0 374 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 THAP11Q96EK4 314 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 QRFPRQ96P65 431 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR52E6Q96RD3 313 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 EBF4Q9BQW3 602 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 AGAP14A8MT82 685 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 HS6ST1O60243 411 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZWINTO95229 277 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ETHE1O95571 254 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NR2F1P10589 423 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 G6PDP11413 515 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ABOP16442 354 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 IMPDH1P20839 514 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GRB7Q14451 532 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NCF4Q15080 339 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NKG7Q16617 165 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CYP51A1Q16850 503 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 STEAP4Q687X5 459 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PAOXQ6QHF9 649 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 HSDL2Q6YN16 418 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 STX12Q86Y82 276 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MICU2Q8IYU8 434 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SEC14L1Q92503 715 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 BORCS5Q969J3 196 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 BTBD9Q96Q07 612 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CRLF2Q9HC73 371 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNF175Q9Y473 711 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.59□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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