RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN2CQ14957 1233 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 XKRXQ6PP77 449 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 LIPIQ6XZB0 460 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RTL10Q7L3V2 364 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 NELL2Q99435 816 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 APOOQ9BUR5 198 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 OR10A4Q9H209 315 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD13AQ14CX5 517 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 NKAPLQ5M9Q1 402 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 FTMTQ8N4E7 242 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 POGLUT1Q8NBL1 392 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 SLC41A3Q96GZ6 507 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT13Q9NPJ3 140 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 GPR83Q9NYM4 423 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CLCA1A8K7I4 914 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 HBQ1P09105 142 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC13P31276 330 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK1DP48730 415 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ZER1Q7Z7L7 766 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TIGD4Q8IY51 512 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DIO2Q92813 273 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MSLNLQ96KJ4 702 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR6Q9GZN1 396 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 I3L521 148 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DDCP20711 480 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ERP29P30040 261 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A9P82251 487 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DSC1Q08554 894 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 OR4K13Q8NH42 304 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 NEIL2Q969S2 332 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DTD2Q96FN9 168 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 HDHD5Q9BXW7 423 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DMRT3Q9NQL9 472 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RDH8Q9NYR8 311 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PET100P0DJ07 73 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DS3Q14952 304 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PROX2Q3B8N5 592 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CHRFAM7AQ494W8 412 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJA3Q96EY1 480 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 BIRC8Q96P09 236 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 SLC46A2Q9BY10 475 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RABL2BQ9UNT1 228 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH17O14917 1159 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 GNAO1P09471 354 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 LHCGRP22888 699 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 FAM76BQ5HYJ3 339 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf189Q5VU69 101 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PLBD1Q6P4A8 553 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CNTN4Q8IWV2 1026 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CLSTN3Q9BQT9 956 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 FTSJ1Q9UET6 329 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RIMS3Q9UJD0 308 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CD8B2A6NJW9 211 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MITFO75030 526 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 OR7A10O76100 309 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CD3GP09693 182 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF806P0C7X5 589 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CD8BP10966 210 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 WDR5P61964 334 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TBRG1Q3YBR2 411 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CPZQ66K79 652 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 WDR20Q8TBZ3 569 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CIB4A0PJX0 185 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ARNTLO00327 626 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 UCHL1P09936 223 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 PCGF2P35227 344 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN2CP42773 168 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MECP2P51608 486 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 LBX1P52954 281 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 GK3PQ14409 553 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 MICAQ29983 383 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2A3Q6UWM9 527 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD60Q9BZ19 345 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 VAPAQ9P0L0 249 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ABCG2Q9UNQ0 655 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0U1RQS6 177 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 GPX3P22352 226 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 GGT2P36268 569 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB110Q30KQ9 67 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf119Q9NWQ9 140 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM181Q9P2C4 612 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms