RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 CDNFQ49AH0 187 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 DPPA4Q7L190 304 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PREBQ9HCU5 417 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 APMAPQ9HDC9 416 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PSAT1Q9Y617 370 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 EGFP01133 1207 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 NRLP54845 237 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CD83Q01151 205 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RIN1Q13671 783 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OSTM1Q86WC4 334 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KIF18BQ86Y91 864 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ESAMQ96AP7 390 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KCNA7Q96RP8 456 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 A8MUA0 341 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 I3L521 148 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 P2RX6O15547 441 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 C6P13671 934 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RAB8AP61006 207 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 LRR1Q96L50 414 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 PCTPQ9UKL6 214 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TOR1AO14656 332 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 STC2O76061 302 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CSN2P05814 226 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OR12D1P0DN82 309 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 LHCGRP22888 699 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 GPR176Q14439 515 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CFHP08603 1231 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FGF4P08620 206 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 BDH1Q02338 343 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 NSDHLQ15738 373 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MLIPQ5VWP3 458 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CES4AQ5XG92 561 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MSANTD3Q96H12 275 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CREBZFQ9NS37 354 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 AURKAO14965 403 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 MAFKO60675 156 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 GGT2P36268 569 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SRPXP78539 464 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CST6Q15828 149 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SLC6A7Q99884 636 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SLC1A7O00341 560 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 BRINP1O60477 761 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS4O75173 837 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CER1O95813 267 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FOLR3P41439 243 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SPHARQ15513 63 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 NIPAL3Q6P499 406 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KCTD9Q7L273 389 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 CNTN4Q8IWV2 1026 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 BORCS6Q96GS4 357 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 BTF3L4Q96K17 158 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ABCG5Q9H222 651 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PP55 124 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 H3BSA7 217 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 FOSL1P15407 271 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRT-201ENST00000356100 KDELR2P33947 212 aa5.72□□□□□ -1.49
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