RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 TO15178 435 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TYROBPO43914 113 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ABCB7O75027 752 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CASP3P42574 277 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 KIAA0040Q15053 153 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GXYLT1Q4G148 440 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 WLSQ5T9L3 541 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 BICRALQ6AI39 1079 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 Q6ZSR9 355 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CROCCP2Q86T23 111 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 VSTM2LQ96N03 204 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CENPHQ9H3R5 247 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 A0A087WV62 115 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ERLIN1O75477 346 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 REM1O75628 298 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 BPGMP07738 259 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CREB1P16220 341 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 IL12BP29460 328 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SNTA1Q13424 505 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GALNTL6Q49A17 601 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM107Q6UX40 140 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ACAD11Q709F0 780 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OR7G2Q8NG99 324 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OR2T11Q8NH01 316 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 AGR3Q8TD06 166 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMBIM1Q969X1 311 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMCO6Q96DC7 493 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 COL21A1Q96P44 957 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.73□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM233B4DJY2 109 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PIP5K1BO14986 540 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PDPK1O15530 556 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 WDR1O75083 606 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TRAPPC6AO75865 159 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MYZAPP0CAP1 466 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SDC1P18827 310 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TACR1P25103 407 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ACVR2AP27037 513 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MAPK1P28482 360 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MC3RP41968 323 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ASMTP46597 345 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 EFR3AQ14156 821 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 EMC4Q5J8M3 183 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ASB5Q8WWX0 329 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 RND1Q92730 232 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 HGDQ93099 445 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 MARVELD3Q96A59 401 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PPCDCQ96CD2 204 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 FCRL1Q96LA6 429 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TSSK3Q96PN8 268 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 REEP4Q9H6H4 257 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM114B3SHH9 223 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 PLOD2O00469 737 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 UGT2B11O75310 529 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-201ENST00000344376 CT45A8P0DMV1 189 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms