RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 LTB4RQ15722 352 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PRTGQ2VWP7 1150 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 NETO1Q8TDF5 533 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SEPHS2Q99611 448 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 RAB33BQ9H082 229 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 AP4S1Q9Y587 144 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ELOVL7A1L3X0 281 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM64A6NGJ6 449 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM64BA6NI03 449 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 DYRK3O43781 588 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SCELO95171 688 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 AQP1P29972 269 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 GPC1P35052 558 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGDIAP52565 204 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC157Q569K6 752 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 IFI44Q8TCB0 444 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 KAT2AQ92830 837 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 NLNQ9BYT8 704 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.3■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 GDF9O60383 454 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 GPX2P18283 190 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 RRM2P31350 389 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MVDP53602 400 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 RGNQ15493 299 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 NCLNQ969V3 563 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF347Q96SE7 839 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 DOK1Q99704 481 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TRAV6A0A075B6T7 132 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SHOXO15266 292 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 CHST10O43529 356 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 CLPXO76031 633 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 RHDQ02161 417 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 BNIP2Q12982 314 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 NRF1Q16656 503 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 KRT80Q6KB66 452 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MICU2Q8IYU8 434 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 LILRA2Q8N149 483 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 CA13Q8N1Q1 262 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 OR1L3Q8NH93 324 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM63Q969Q1 353 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MARC2Q969Z3 335 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PEX11GQ96HA9 241 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 FANCFQ9NPI8 374 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.29■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 OR2B3O76000 313 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 DCKP27707 260 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TNFRSF17Q02223 184 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PMS2P3Q13401 168 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TP53BP2Q13625 1128 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 MAPK11Q15759 364 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM107Q6UX40 140 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 PTOV1Q86YD1 416 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO30Q8TB52 745 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 CXCR6O00574 342 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 BCL10O95999 233 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 GGT1P19440 569 aa15.28■□□□□ 0.04
CHTF18-202ENST00000317063 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms