RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 OR56B4Q8NH76 319 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SDHAF3Q9NRP4 125 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 CLDN5O00501 218 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDH7O60245 1069 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 IRF2P14316 349 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MAXP61244 160 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 GK3PQ14409 553 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 DUOXA1Q1HG43 343 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM69AQ5T7M9 428 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 TTLQ8NG68 377 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 CLCF1Q9UBD9 225 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PCCBP05166 539 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC11A1P49279 550 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SHC3Q92529 594 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PRRT1Q99946 306 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 GP1BBP13224 206 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 HTR3AP46098 478 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 GTF2BQ00403 316 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ARHGAP1Q07960 439 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2T27Q8NH04 317 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 REEP6Q96HR9 211 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SENP8Q96LD8 212 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 TPMTP51580 245 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PLA2G7Q13093 441 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 IRGQQ8WZA9 623 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 EXTL1Q92935 676 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP3CBP16298 524 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ENGP17813 658 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 BCKDHBP21953 392 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MEDAGQ5VYS4 303 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 YDJCA8MPS7 323 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 THBS1P07996 1170 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 LAP3P28838 519 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MALLQ13021 153 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 RIPK3Q9Y572 518 aa10.69□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 C5P01031 1676 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 KRBA1A5PL33 1030 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 IRF9Q00978 393 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF74Q16587 644 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MEP1AQ16819 746 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM35AQ53FP2 167 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD11Q8NFV4 315 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 THAP4Q8WY91 577 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 FGGYQ96C11 551 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 GAB2Q9UQC2 676 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SOX14O95416 240 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 C2P06681 752 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SSTR2P30874 369 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC6A6P31641 620 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 LMX1AQ8TE12 382 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 HELTA6NFD8 242 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 F6UZH7 168 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 FABP1P07148 127 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 NTF3P20783 257 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SOX9P48436 509 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 EPOP01588 193 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 MTHFD2P13995 350 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 AK4P27144 223 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 DESI1Q6ICB0 168 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF546Q86UE3 836 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 TPRA1Q86W33 373 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 NATD1Q8N6N6 113 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 OR13C2Q8NGS9 318 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 RELTQ969Z4 430 aa10.68□□□□□ -0.7
HDGFL3-201ENST00000299633 HBEGFQ99075 208 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms