RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 NT5C3BQ969T7 300 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 LRR1Q96L50 414 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ATOH8Q96SQ7 321 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 LRRC42Q9Y546 428 aa10.1□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 A0A0X1KG70 313 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 J3QRK9 145 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 NME4O00746 187 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 SCRG1O75711 98 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ITGB8P26012 769 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 CRISP1P54107 249 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 HOXC5Q00444 222 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PIGFQ07326 219 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 CCNJQ5T5M9 372 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PGBD2Q6P3X8 592 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 GID4Q8IVV7 300 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 WBP2Q969T9 261 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TBC1D20Q96BZ9 403 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PGAM5Q96HS1 289 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 CHIAQ9BZP6 476 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 FGF21Q9NSA1 209 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 CUTCQ9NTM9 273 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PRRT4C9JH25 899 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 H0Y8X5 98 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF10O60809 474 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 GSTT2BP0CG30 244 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 FNTBP49356 437 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PRKXP51817 358 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PITPNAQ00169 270 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 BNIP3Q12983 259 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 MEDAGQ5VYS4 303 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ZNF740Q8NDX6 193 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 OR5B2Q96R09 309 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 SLC22A1O15245 554 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 GKN3PP0CG01 181 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 F8A1P23610 371 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 CLCA4Q14CN2 919 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TYSND1Q2T9J0 566 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 C4orf46Q504U0 113 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TMEM17Q86X19 198 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 OR5K2Q8NHB8 316 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 FRMD6Q96NE9 622 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ZNF639Q9UID6 485 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 GABRR3A8MPY1 467 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 H3BSA7 217 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 FESP07332 822 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PSKH1P11801 424 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ACVR1BP36896 505 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ETV4P43268 484 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 TLE3Q04726 772 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 CBFBQ13951 182 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 NKAIN2Q5VXU1 208 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 IGFN1Q86VF2 1251 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 PROKR1Q8TCW9 393 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 NETO1Q8TDF5 533 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 ZNF559Q9BR84 538 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 NTMT1Q9BV86 223 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 VAPAQ9P0L0 249 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 KLHL42Q9P2K6 505 aa10.09□□□□□ -0.79
TMX3-201ENST00000299608 C5orf51A6NDU8 294 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 LINC01565O15544 149 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 CXCL10P02778 98 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 VAMP1P23763 118 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 DCDC1P59894 354 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 ZNF33BQ06732 778 aa10.08□□□□□ -0.8
TMX3-201ENST00000299608 NPRL3Q12980 569 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 276.2 ms