RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 RNF44Q7L0R7 432 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 UBE2E3Q969T4 207 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 COQ10AQ96MF6 247 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 OR10A4Q9H209 315 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 H3BNC9 293 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 L7N2F9 121 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 SLC22A5O76082 557 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 ADRA2AP08913 450 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 WASP42768 502 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 MPPE1Q53F39 396 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 KIF18BQ86Y91 864 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 CPOQ8IVL8 374 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 RAD9AQ99638 391 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP25-201ENST00000285679 SOCS5O75159 536 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PCDH8O95206 1070 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PYCR1P32322 319 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 CD79BP40259 229 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 GALEQ14376 348 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SYT9Q86SS6 491 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.46□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 IGLV3-27P01718 113 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 APOC3P02656 99 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 FURINP09958 794 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ELK1P19419 428 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SHC1P29353 583 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PKLRP30613 574 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SP140Q13342 867 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ILKQ13418 452 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 OR8K5Q8NH50 307 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SMPDL3AQ92484 453 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 IFT27Q9BW83 186 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 LEFTY1O75610 366 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 GALTP07902 379 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 GCGRP47871 477 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ARHGDIBP52566 201 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 GPR176Q14439 515 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 NIPAL2Q9H841 368 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 A0A0A6YYJ9 748 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PRODHO43272 600 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF15O94989 841 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 CD160O95971 181 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 C4BPBP20851 252 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SLC6A12P48065 614 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 RDH10Q8IZV5 341 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 CACNG2Q9Y698 323 aa14.45□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 IRGMA1A4Y4 181 aa14.44□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 MMP20O60882 483 aa14.44□□□□□ -0.1
USP25-201ENST00000285679 ALDOBP05062 364 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms