RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 TACR2P21452 398 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 UBXN11Q5T124 520 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 SYT9Q86SS6 491 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 MON1AQ86VX9 555 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 ATAD1Q8NBU5 361 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 FCRL1Q96LA6 429 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 GULP1Q9UBP9 304 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 KIF25Q9UIL4 384 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 SIP14410 1827 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRR-201ENST00000283228 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00587B1AMM8 73 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 M0R3H8 397 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SEC14L5O43304 696 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 NMBP08949 121 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 LIM2P55344 173 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL36Q8N4N3 616 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PPTC7Q8NI37 304 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ASIC5Q9NY37 505 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 MED11Q9P086 117 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SLC28A2O43868 658 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 CLDN7O95471 211 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 WDPCPO95876 746 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TGFB1P01137 390 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ADRB1P08588 477 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PRKAG1P54619 331 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 FGL1Q08830 312 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 MPEG1Q2M385 716 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SLC6A19Q695T7 634 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 CDC73Q6P1J9 531 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 MTG2Q9H4K7 406 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 AUP1Q9Y679 476 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GW55 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 M0QZ92 97 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SCN2BO60939 215 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4L2P0CJ85 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4L3P0CJ86 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4L4P0CJ87 422 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4L5P0CJ88 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 FOSL1P15407 271 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ACVR1BP36896 505 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 GIPRP48546 466 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TAP2Q03519 686 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ILKQ13418 452 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TUSC3Q13454 348 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC73Q5JTD7 316 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 Q6ZTK2 550 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 BBS10Q8TAM1 723 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 KCNJ15Q99712 375 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ACBD6Q9BR61 282 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 CRB3Q9BUF7 120 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 PRR14Q9BWN1 585 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 DUX4Q9UBX2 424 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 FMO6PO60774 539 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 FZD7O75084 574 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A27O95847 323 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 CXCL2P19875 107 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 SLC11A2P49281 568 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 GSG1Q2KHT4 349 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRR-201ENST00000283228 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms