RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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ANKRD54-201ENST00000215941 GPR137Q96N19 417 aa21.53■■□□□ 1.04
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ANKRD54-201ENST00000215941 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.5■■□□□ 1.03
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ANKRD54-201ENST00000215941 MED17Q9NVC6 651 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-201ENST00000215941 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.5■■□□□ 1.03
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ANKRD54-201ENST00000215941 CTNNB1P35222 781 aa21.5■■□□□ 1.03
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ANKRD54-201ENST00000215941 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-201ENST00000215941 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-201ENST00000215941 UCN3Q969E3 161 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-201ENST00000215941 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-201ENST00000215941 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
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ANKRD54-201ENST00000215941 GALNT9Q9HCQ5 603 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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