RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 KRT87PA6NCN2 255 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 IDH3BO43837 385 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 UGT2B17O75795 530 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TYRP1P17643 537 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SPINK2P20155 84 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TGFBR1P36897 503 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GPR3P46089 330 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 PDX1P52945 283 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 KCNJ10P78508 379 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CFHR1Q03591 330 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 KRT33BQ14525 404 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 USP53Q70EK8 1073 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 KRT73Q86Y46 540 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 AVL9Q8NBF6 648 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 UBE2FQ969M7 185 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 RUBCNLQ9H714 662 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 AKAP13Q12802 2813 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 LILRA5A6NI73 299 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 UGDHO60701 494 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SCN2BO60939 215 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 DIRAS1O95057 198 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 C8GP07360 202 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ADORA3P0DMS8 318 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 EPORP19235 508 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CD1CP29017 333 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 PRIM2P49643 509 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 COPZ1P61923 177 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 E2F1Q01094 437 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 RSC1A1Q92681 617 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ARL15Q9NXU5 204 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 D6RAR5 112 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TNFRSF11BO00300 401 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ITGA2P17301 1181 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HIST1H2ADP20671 130 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 TACR1P25103 407 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 PCGF2P35227 344 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SLC15A1P46059 708 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HTR3AP46098 478 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 BDKRB1P46663 353 aa14.6□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 FRG2Q64ET8 278 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CEP19Q96LK0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 FRG2BQ96QU4 278 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.6□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 SLC16A5O15375 505 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 UBXN7O94888 489 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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CLN8-209ENST00000635970 EPHA4P54764 986 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 WNT3P56703 355 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 PPP1CAP62136 330 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 SELENOWP63302 87 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.59□□□□□ -0.07
CLN8-209ENST00000635970 OR10G6Q8NH81 332 aa14.59□□□□□ -0.07
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