RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 ILKQ13418 452 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 FCRLBQ6BAA4 426 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 BHLHB9Q6PI77 547 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZER1Q7Z7L7 766 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PGBD3Q8N328 593 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 AMER3Q8N944 861 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLC37A3Q8NCC5 494 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 EXTL2Q9UBQ6 330 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SCN3AQ9NY46 2000 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 IGLON5A6NGN9 336 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 REM1O75628 298 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PRG2P13727 222 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 TM4SF4P48230 202 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MVDP53602 400 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 RHAGQ02094 409 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF33BQ06732 778 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 DHCR24Q15392 516 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 TATDN3Q17R31 274 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MFSD4BQ5TF39 518 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 VRK2Q86Y07 508 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF671Q8TAW3 534 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PIGKQ92643 395 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 FTSJ1Q9UET6 329 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF860A6NHJ4 632 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 H3BQ06 376 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLC31A1O15431 190 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 TMPRSS11DO60235 418 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ADRA2AP08913 450 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 BMPR1AP36894 532 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MMP12P39900 470 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SGCGQ13326 291 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SYT14P1Q58G82 188 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 NOXA1Q86UR1 476 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 LRRTM4Q86VH4 590 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 NRMQ8IXM6 262 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 OR10G6Q8NH81 332 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.04□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 CTBP2P56545 445 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 CLDN2P57739 230 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PSPHP78330 225 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 LRRC32Q14392 662 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 UNC5DQ6UXZ4 953 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 DPPA4Q7L190 304 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 UXS1Q8NBZ7 420 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZSWIM3Q96MP5 696 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MCHR1Q99705 422 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SEMG1P04279 462 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLC6A11P48066 632 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SLX4IPQ5VYV7 408 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 RNF165Q6ZSG1 346 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SAMD12Q8N8I0 201 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 OR52L1Q8NGH7 329 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 OR6F1Q8NGZ6 308 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PDXPQ96GD0 296 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 SPATA2Q9UM82 520 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 HEPACAM2A8MVW5 462 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 H3BSH0 61 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 HMGN4O00479 90 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ORC5O43913 435 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 ACVR1BP36896 505 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 BTN3A2P78410 334 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PRR5P85299 388 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 PCDH1Q08174 1060 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 E2F2Q14209 437 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 IRF3Q14653 427 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.03□□□□□ -0.32
HPS1-215ENST00000613394 LUZP2Q86TE4 346 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms