RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612791.4

MED25-209, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 5 BASIC

Gene MED25, Length 881 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-209	ENST00000612791	SGO1	Q5FBB7	561 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	MED27	Q6P2C8	311 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	RNF175	Q8N4F7	328 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	TRPV3	Q8NET8	790 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	C3orf30	Q96M34	536 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	HBEGF	Q99075	208 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	RHBG	Q9H310	441 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SNX6	Q9UNH7	406 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	DYSF	O75923	2080 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	FCHO1	O14526	889 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SNX3	O60493	162 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	FAM107A	O95990	144 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PDYN	P01213	254 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	IGHG3	P01860	377 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KRT6A	P02538	564 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KRT6B	P04259	564 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KRT6C	P48668	564 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	AQP5	P55064	265 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CBX1	P83916	185 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SORD	Q00796	357 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	HYAL2	Q12891	473 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	IFT88	Q13099	833 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SPATA21	Q7Z572	469 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	NAXE	Q8NCW5	288 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	OR2T11	Q8NH01	316 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	STON2	Q8WXE9	905 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	UBE2E3	Q969T4	207 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SMIM10	Q96HG1	83 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KLHL31	Q9H511	634 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	WDR1	O75083	606 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ULK1	O75385	1050 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	ETHE1	O95571	254 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CHEK2	O96017	543 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SERPINA6	P08185	405 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	LINC00032	P0C843	101 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PCNA	P12004	261 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PAX1	P15863	534 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SERPINB1	P30740	379 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	THBS2	P35442	1172 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	PIK3CB	P42338	1070 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	IDH3A	P50213	366 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	CLCN2	P51788	898 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	BTN3A2	P78410	334 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	HMGCS1	Q01581	520 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76	2e-6	■■■■■ 30.7
MED25-209	ENST00000612791	TNK1	Q13470	666 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MED25-209	ENST00000612791	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.29	□□□□□ -0.76

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