RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608963.1

AC004877.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004877.1, Length 4,093 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004877.1-201ENST00000608963 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 LRRC32Q14392 662 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 RRM2BQ7LG56 351 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 SCAIQ8N9R8 606 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 FCGR1BQ92637 280 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.9□□□□□ -0.82
AC004877.1-201ENST00000608963 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 GKN3PP0CG01 181 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SDC2P34741 201 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 LIMS1P48059 325 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 KCNJ5P48544 419 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 UBE2E3Q969T4 207 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ZNF607Q96SK3 696 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.9□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 CCNKO75909 580 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 FUT5Q11128 374 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 GAB4Q2WGN9 574 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 LCTLQ6UWM7 567 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 HSDL2Q6YN16 418 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TMEM80Q96HE8 168 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 RAD9AQ99638 391 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 IL23AQ9NPF7 189 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 STARD5Q9NSY2 213 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 LRIT2A6NDA9 550 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ASNA1O43681 348 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 KAT7O95251 611 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 AIFM1O95831 613 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TSPAN19P0C672 248 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 GNSP15586 552 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 S100A1P23297 94 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 PPP2R1BP30154 601 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SLC15A1P46059 708 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 EPHA5P54756 1037 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 C21orf58P58505 322 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 GPR68Q15743 365 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 METRNLQ641Q3 311 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 KIF18BQ86Y91 864 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 BBS10Q8TAM1 723 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 PATE1Q8WXA2 126 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 GJA4P35212 333 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TUBA1BP68363 451 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 DEFB134Q4QY38 66 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TUBA1AQ71U36 451 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 TM9SF4Q92544 642 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.89□□□□□ -0.83
AC004877.1-201ENST00000608963 SEC16AO15027 2179 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms