RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ARSFP54793 590 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OCA2Q04671 838 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RBBP7Q16576 425 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SGO1Q5FBB7 561 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 COQ5Q5HYK3 327 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OGFOD2Q6N063 350 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF145Q96MT1 663 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 COG8Q96MW5 612 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TPK1Q9H3S4 243 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NANOGQ9H9S0 305 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FITM1A5D6W6 292 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 IDSB3KWA1 339 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A3O75751 556 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL18O94889 574 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 LDLRP01130 860 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 HBQ1P09105 142 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 MLLT10P55197 1068 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 IRF8Q02556 426 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNAB2Q13303 367 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FGD3Q5JSP0 725 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 KIRREL2Q6UWL6 708 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 LZICQ8WZA0 190 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TSLPQ969D9 159 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 F2RL3Q96RI0 385 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDT9Q9BW91 350 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXL4Q9UKA2 621 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MUA0 341 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 H0YC42 278 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 SNPHO15079 494 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TGFB1P01137 390 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 GBAP04062 536 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TFPTP0C1Z6 253 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR35P0CG20 571 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 HRH2P25021 359 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGA3P26006 1051 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 IL12AP29459 219 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4D2P58180 307 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PLIN5Q00G26 463 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT8Q16880 541 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDT8Q8WV74 236 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP11Q96EK4 314 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CHID1Q9BWS9 393 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CD244Q9BZW8 370 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS4BO75351 444 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ESRRBO95718 433 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CHEK2O96017 543 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RAC2P15153 192 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 CD247P20963 164 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 BTN3A2P78410 334 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 BTG2P78543 158 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX19Q8NA77 164 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 OR51B5Q9H339 312 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms