RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 FUT7Q11130 342 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TP53BP2Q13625 1128 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ERV3-1Q14264 604 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 GNA13Q14344 377 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 EXT1Q16394 746 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SFT2D3Q587I9 215 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SAXO2Q658L1 398 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM107Q6UX40 140 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SZRD1Q7Z422 152 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 NUP43Q8NFH3 380 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ZFP90Q8TF47 636 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 NUDT8Q8WV74 236 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TSLPQ969D9 159 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 NKD1Q969G9 470 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ELP4Q96EB1 424 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 NEURL3Q96EH8 262 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 FBXL20Q96IG2 436 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC45A3Q96JT2 553 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ECSITQ9BQ95 431 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 MUC13Q9H3R2 512 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 DKK4Q9UBT3 224 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-213ENST00000589475 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CFAP73A6NFT4 308 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CLIC1O00299 241 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 UPK1AO00322 258 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 GMNNO75496 209 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 PSMG1O95456 288 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CBX7O95931 251 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 HPP00738 406 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 UMODP07911 640 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 ADRB1P08588 477 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 NID1P14543 1247 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 GPX2P18283 190 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC6A2P23975 617 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CPOXP36551 454 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CDKN2CP42773 168 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 CLCN2P51788 898 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 PGDP52209 483 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC7A2P52569 658 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-213ENST00000589475 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms