RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF292O60281 2723 aa28.95■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2W5A6NFC9 320 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC36A6NLP5 189 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C9J4A7 227 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TM4SF5O14894 197 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF2O60811 474 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX7O95931 251 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TNNI3P19429 210 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SNCBQ16143 134 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ATAD3BQ5T9A4 648 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKBIDQ8NI38 313 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC38A5Q8WUX1 472 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CANT1Q8WVQ1 401 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 XAGE5Q8WWM1 108 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TSLPQ969D9 159 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 STACQ99469 402 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRA2Q9H9E1 313 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 EQTNQ9NQ60 294 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC1Q9NVT9 282 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 AP4S1Q9Y587 144 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 H0Y3Z8 333 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE9AO76083 593 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA14P01570 189 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HEXBP07686 556 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCN2P51788 898 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NHLH1Q02575 133 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LAPTM4BQ86VI4 370 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS12Q86WS5 348 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM151BQ8IW70 566 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRG5Q8IZF4 528 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5D16Q8NGK9 328 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 OR14A16Q8NHC5 309 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB8BQ92930 207 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PMEPA1Q969W9 287 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf58Q96GQ5 468 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP22Q9NRW4 184 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CALML5Q9NZT1 146 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf105B2RV13 164 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 IDSB3KWA1 339 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BNX3 289 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN8OSP0DMR3 200 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CRB2Q5IJ48 1285 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MR1Q95460 341 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL20Q96IG2 436 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SPSB2Q99619 263 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGUQ9H490 435 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 STK17BO94768 372 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA1P01009 418 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 BCHEP06276 602 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K8P41279 467 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CRISP3P54108 245 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN6P56747 220 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MLIPQ5VWP3 458 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLL1Q75N03 491 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52R1Q8NGF1 315 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL21AQ8WXB1 218 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM19Q96HH6 336 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 YIPF4Q9BSR8 244 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGIXQ9H6Y5 334 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2L10Q9HD36 194 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CFL2Q9Y281 166 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ALOX5P09917 674 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NR2F1P10589 423 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ANPEPP15144 967 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS58Q8IYP2 241 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PHOX2BQ99453 314 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CNPPD1Q9BV87 410 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ADPRHL2Q9NX46 363 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PRODH2Q9UF12 536 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-19Q9WJR5 959 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NINQ8N4C6 2090 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SDK2Q58EX2 2172 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SPEGQ15772 3267 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH17O14917 1159 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ALOX12BO75342 701 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC34A2O95436 690 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 DLGAP3O95886 979 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 AK1P00568 194 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 EFNA3P52797 238 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 EMP2P54851 167 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM198BQ6UWH4 519 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A11Q8NCK7 471 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 BBS10Q8TAM1 723 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms