RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 RASA2Q15283 850 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SIMC1Q8NDZ2 872 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TNIP2Q8NFZ5 429 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF675Q8TD23 568 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 KLHL29Q96CT2 875 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 MTBPQ96DY7 904 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 OMA1Q96E52 524 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF382Q96SR6 550 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 HBEGFQ99075 208 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SH3GL2Q99962 352 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 BCAP29Q9UHQ4 241 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 PLLPQ9Y342 182 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SNPHO15079 494 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TO15178 435 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DLX3O60479 287 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SUPT7LO94864 414 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZWINTO95229 277 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 KRT6AP02538 564 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 KRT6BP04259 564 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 BMP7P18075 431 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DRD5P21918 477 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 PPICP45877 212 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 KRT6CP48668 564 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ASCL1P50553 236 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SNTA1Q13424 505 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 NNATQ16517 81 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 EIPR1Q53HC9 387 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 OR52R1Q8NGF1 315 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF592Q92610 1267 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 WDYHV1Q96HA8 205 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TMEM237Q96Q45 408 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 NODALQ96S42 347 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 HEY2Q9UBP5 337 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 PRODH2Q9UF12 536 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 SLC6A5Q9Y345 797 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 FAM221AA4D161 298 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 CD8B2A6NJW9 211 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DVL2O14641 736 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 GNB5O14775 395 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 CTAG2O75638 210 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 IMPDH1P20839 514 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ALDH9A1P49189 494 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 EMDP50402 254 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 LTB4RQ15722 352 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TEX35Q5T0J7 233 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DESI1Q6ICB0 168 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ERP27Q96DN0 273 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 METTL7AQ9H8H3 244 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 C2CD3Q4AC94 2353 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DOCK7Q96N67 2140 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 FRG2CA6NGY1 282 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ICOSLGO75144 302 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 UGT2B11O75310 529 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ULK1O75385 1050 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 IL2RAP01589 272 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DRD2P14416 443 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 CD1EP15812 388 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 CHN1P15882 459 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 PCSK2P16519 638 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 BMP5P22003 454 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 KIR2DL3P43628 341 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ZNF136P52737 540 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 NAGLUP54802 743 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 WNT3P56703 355 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 RAE1P78406 368 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 CEBPEQ15744 281 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 DCST1Q5T197 706 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-206ENST00000588345 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms