RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SNX15Q9NRS6 342 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 WHRNQ9P202 907 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CADP27708 2225 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A088AWK7 358 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CTAGE9A4FU28 777 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 DPRXA6NFQ7 191 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR6C76A6NM76 312 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CAPN14A8MX76 684 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 VWC2LB2RUY7 222 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ZIC3O60481 467 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PRAMEF4O60810 478 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RAMP1O60894 148 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CBR3O75828 277 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 AQP8O94778 261 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HAUS5O94927 633 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 AIFM1O95831 613 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 GUCA1CO95843 209 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 IFNB1P01574 187 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC166P0CW27 439 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HIST1H2ADP20671 130 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ABCD3P28288 659 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SRD5A2P31213 254 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SSTR4P31391 388 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC1A2P43004 574 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PGGT1BP53609 377 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 AP1S2P56377 157 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PLIN5Q00G26 463 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RCN2Q14257 317 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 BCL2A1Q16548 175 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 AAGABQ6PD74 315 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 BANPQ8N9N5 519 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM168AQ92567 244 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 S100PBPQ96BU1 408 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 LINGO1Q96FE5 620 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SFXN2Q96NB2 322 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 NDNQ99608 321 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PINK1Q9BXM7 581 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 OR10A4Q9H209 315 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ALG2Q9H553 416 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 BFARQ9NZS9 450 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PS29 197 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 C17orf51A8MQB3 221 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SHISA9B4DS77 424 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM157AC9JC47 383 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 LIASO43766 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TNFRSF21O75509 655 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PPM1BO75688 479 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 LY6HO94772 140 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 SCELO95171 688 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CT62P0C5K7 136 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CPN2P22792 545 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGEA1P43355 309 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 GATA4P43694 442 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 CDKN2DP55273 166 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 C21orf58P58505 322 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 ACTG1P63261 375 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 BSPH1Q075Z2 132 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-217ENST00000580654 FGFBP1Q14512 234 aa6.84□□□□□ -1.31
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