RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	NEK5	Q6P3R8	708 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GPBP1	Q86WP2	473 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CDC20B	Q86Y33	519 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GPATCH11	Q8N954	259 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	OR52J3	Q8NH60	311 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FCGR1B	Q92637	280 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NTNG2	Q96CW9	530 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SAMD8	Q96LT4	415 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CPXM1	Q96SM3	734 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ALG9	Q9H6U8	611 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MLX	Q9UH92	298 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FZR1	Q9UM11	496 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RNF24	Q9Y225	148 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FKBP7	Q9Y680	259 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZMYM6	O95789	1325 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	BUB1	O43683	1085 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SSX5	O60225	188 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GPRIN2	O60269	458 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NUDT14	O95848	222 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FAM200B	P0CF97	657 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GP9	P14770	177 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RFC2	P35250	354 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SLC6A8	P48029	635 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CAMLG	P49069	296 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NUMB	P49757	651 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ARHGDIA	P52565	204 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HMGCS2	P54868	508 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HAND2	P61296	217 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SRY	Q05066	204 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	BNIP1	Q12981	228 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SNX1	Q13596	522 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GAMT	Q14353	236 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SLC10A1	Q14973	349 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF699	Q32M78	642 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ATRAID	Q6UW56	229 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HPS6	Q86YV9	775 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NAXD	Q8IW45	347 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FGFRL1	Q8N441	504 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ARL14	Q8N4G2	192 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TBCK	Q8TEA7	893 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	KRT23	Q9C075	422 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	C1orf21	Q9H246	121 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	TSPY26P	Q9H489	355 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	AMBN	Q9NP70	447 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CENPM	Q9NSP4	180 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CUTC	Q9NTM9	273 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		2.55	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123		A0A087WWV3	80 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	LRIT2	A6NDA9	550 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PRPSAP2	O60256	369 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	SDC3	O75056	442 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RHBDL1	O75783	438 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	STK17B	O94768	372 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	KBTBD11	O94819	623 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	PIGR	P01833	764 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	RPA1	P27694	616 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	CHRNA3	P32297	505 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	GMFB	P60983	142 aa		2.54	□□□□□ -2
BBS2-208	ENST00000564123	IL1RL1	Q01638	556 aa		2.54	□□□□□ -2

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