RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDF	Q9HBH1	243 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	DHRS7	Q9Y394	339 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787		G3V3Y1	287 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	BUB1	O43683	1085 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	COPB2	P35606	906 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	XCR1	P46094	333 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	SERTAD2	Q14140	314 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF410	Q86VK4	478 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	CASD1	Q96PB1	797 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPY26P	Q9H489	355 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PAPOLA-222	ENST00000556787	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787		H0Y9J4	135 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GOSR1	O95249	250 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYNGR4	O95473	234 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LAMP1	P11279	417 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAS	P25445	335 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPA1	P27694	616 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMOD1	P28289	359 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LHX4	Q969G2	390 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAF2	Q96CS3	445 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787		Q9UF83	564 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF175	Q9Y473	711 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNR	Q92752	1358 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	LYPD3	O95274	346 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV3-9	P01782	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CASP9	P55211	416 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CXCL6	P80162	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDP	Q00604	133 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZIC1	Q15915	447 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF79	Q15937	498 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAPH1	Q70E73	1250 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPC24	Q8NBT2	197 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF560	Q96MR9	790 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACCS	Q96QU6	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	APOO	Q9BUR5	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GRIN2D	O15399	1336 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXB7	P09629	217 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	NPY2R	P49146	381 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPA4	Q13156	261 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM110	Q86TL2	294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPBP1	Q86WP2	473 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms