RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555497.5

TMEM260-207, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM260, Length 2,218 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-207ENST00000555497 ILKQ13418 452 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 COL19A1Q14993 1142 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SYT16Q17RD7 645 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 BCL7BQ9BQE9 202 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 UGT2B17O75795 530 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TP53P04637 393 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CD36P16671 472 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ST3GAL4Q11206 333 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PTCHD4Q6ZW05 846 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 COL26A1Q96A83 441 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 BTBD2Q9BX70 525 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.8■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 A0A1W2PRQ8 180 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TNFP01375 233 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SOX18P35713 384 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 XKP51811 444 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 FBXO43Q4G163 708 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC15A4Q8N697 577 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC35A4Q96G79 324 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SERINC2Q96SA4 455 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.79■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC22A1O15245 554 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 VRK2Q86Y07 508 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 IL4I1Q96RQ9 567 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ITPAQ9BY32 194 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 H0YGG7 62 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 RABIFP47224 123 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 UGT2B15P54855 530 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SMIM11AP58511 58 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 GNA13Q14344 377 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PINK1Q9BXM7 581 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 DAPP1Q9UN19 280 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 J3QRK9 145 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 FRS3O43559 492 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PFDN1O60925 122 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PTHP01270 115 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PPP1CAP62136 330 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 IRF3Q14653 427 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLX4IPQ5VYV7 408 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 STX19Q8N4C7 294 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 DOK4Q8TEW6 326 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 FCGR1BQ92637 280 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC38A4Q969I6 547 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 BORCS5Q969J3 196 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 GPA33Q99795 319 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 GIN1Q9NXP7 522 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TLR4O00206 839 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 TOR1BO14657 336 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 FCMRO60667 390 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 MMP11P24347 488 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 MORN4Q8NDC4 146 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 PHF11Q9UIL8 331 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-207ENST00000555497 ASNA1O43681 348 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-207ENST00000555497 B3GALT2O43825 422 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-207ENST00000555497 ADORA3P0DMS8 318 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-207ENST00000555497 OPRL1P41146 370 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms