RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 RAD51DO75771 328 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF883P0CG24 379 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 SLC36A2Q495M3 483 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 YY2O15391 372 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 IGFBP5P24593 272 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-209ENST00000550857 STARD6P59095 220 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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