RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 A8MUA0 341 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ADAMDEC1O15204 470 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PDE9AO76083 593 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NPIPA8P0DM63 369 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PTNP21246 168 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RAD23AP54725 363 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RAB38P57729 211 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CEBPEQ15744 281 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CCDC157Q569K6 752 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CCDC80Q76M96 950 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 VRK2Q86Y07 508 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZNF614Q8N883 585 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TANKQ92844 425 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GIMAP5Q96F15 307 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PHOX2BQ99453 314 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 UCK1Q9HA47 277 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 KRT84Q9NSB2 600 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GIN1Q9NXP7 522 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 A8MVJ9 347 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CLDN4O14493 209 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SEMA7AO75326 666 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GADD45GO95257 159 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 IL7RP16871 459 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ITGA2P17301 1181 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TNNI3P19429 210 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SSTR4P31391 388 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SOX18P35713 384 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 AVPR1BP47901 424 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SKP1P63208 163 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GRM7Q14831 915 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PERM1Q5SV97 790 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SATL1Q86VE3 508 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR2L13Q8N349 312 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SLC5A8Q8N695 610 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SAP25Q8TEE9 199 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RIT1Q92963 219 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TCEAL3Q969E4 200 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PIP5K1AQ99755 562 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FGF21Q9NSA1 209 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CUTCQ9NTM9 273 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GTQ1 180 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TMEM221A6NGB7 291 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 M0R296 226 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FFAR1O14842 300 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RECKO95980 971 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MYF6P23409 242 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 HOXA6P31267 233 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GABRA3P34903 492 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GABRA4P48169 554 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 KCNJ5P48544 419 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 EPHA4P54764 986 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 KCNC4Q03721 635 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MEP1AQ16819 746 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TCTE1Q5JU00 501 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 LGI4Q8N135 537 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms