RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SBK3P0C264 359 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PRPS2P11908 318 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 COX6B1P14854 86 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HPGDP15428 266 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN8P19075 237 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 DRD5P21918 477 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PRPH2P23942 346 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 LCN1P31025 176 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GMPRP36959 345 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PPICP45877 212 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TDGF1P3P51864 188 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 EFNA3P52797 238 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR5P85299 388 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TP53BP2Q13625 1128 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SMU1Q2TAY7 513 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HHATQ5VTY9 493 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ATG16L1Q676U5 607 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NOXRED1Q6NXP6 359 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 AAGABQ6PD74 315 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 C10orf107Q8IVU9 208 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 BANPQ8N9N5 519 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TCP10LQ8TDR4 215 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL8AQ96BM9 186 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PPCDCQ96CD2 204 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NPAS2Q99743 824 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MYNNQ9NPC7 610 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MEMO1Q9Y316 297 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM22Q9Y584 194 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.17□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GTH9 108 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GVC2 190 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPB2A8KAH6 182 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM166BA8MTA8 275 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS44E7EML9 344 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BNH8 94 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 HAX1O00165 279 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 PLOD2O00469 737 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 AQP7O14520 342 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TO15178 435 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN1A2O60476 641 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ZG16O60844 167 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6AP2O75787 350 aa5.16□□□□□ -1.58
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAPPC6AO75865 159 aa5.16□□□□□ -1.58
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