RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529285.5

RPS3-213, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 5

Gene RPS3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-213	ENST00000529285	NUP43	Q8NFH3	380 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	VPS33A	Q96AX1	596 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NTM	Q9P121	344 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SNX3	O60493	162 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	DPM1	O60762	260 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	PPIC	P45877	212 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SSR4	P51571	173 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	DCAF7	P61962	342 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	PRR5	P85299	388 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SZRD1	Q7Z422	152 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TAGAP	Q8N103	731 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CCDC115	Q96NT0	180 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	RASL10B	Q96S79	203 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ITPA	Q9BY32	194 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	RNF32	Q9H0A6	362 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	RMND5A	Q9H871	391 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	MRGBP	Q9NV56	204 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CCDC154	A6NI56	674 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CDK2AP1	O14519	115 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	PSMG1	O95456	288 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	DRD5	P21918	477 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CD96	P40200	585 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	HLCS	P50747	726 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TUBA3C	Q13748	450 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TMEM64	Q6YI46	380 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SLC15A4	Q8N697	577 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ASB15	Q8WXK1	588 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	MOAP1	Q96BY2	351 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SPDL1	Q96EA4	605 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	VSTM2L	Q96N03	204 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	PANX1	Q96RD7	426 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TRIM4	Q9C037	500 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SAR1A	Q9NR31	198 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	OR5H15	A6NDH6	313 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NR5A2	O00482	541 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CD1E	P15812	388 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SOAT1	P35610	550 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CASR	P41180	1078 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CD97	P48960	835 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CYB561	P49447	251 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	RCAN2	Q14206	197 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	OPN5	Q6U736	354 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SFXN5	Q8TD22	340 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ITCH	Q96J02	903 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	INPP5K	Q9BT40	448 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	MFRP	Q9BY79	579 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	EQTN	Q9NQ60	294 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	RFXANK	O14593	260 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CCDC22	O60826	627 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	OR6B1	O95007	311 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CT45A8	P0DMV1	189 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CT45A9	P0DMV2	189 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	UQCRC2	P22695	453 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	SOX3	P41225	446 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	NRG3	P56975	720 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	CORO7	P57737	925 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	TP53BP2	Q13625	1128 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
RPS3-213	ENST00000529285	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63

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